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全自動數(shù)字 PCR 儀在我國屬于第三類醫(yī)療器械注冊產(chǎn)品,且不在免于醫(yī)療器械臨床試驗?zāi)夸浿畠?nèi)。該產(chǎn)品基于數(shù)字PCR 檢測原理,與適配試劑配合使用,在臨床上用于對來源于人體樣本中的DNA進(jìn)行定性和定量檢測。本文為大家介紹全自動數(shù)字PCR儀臨床試驗設(shè)計實例,一起看正文。
一、全自動數(shù)字PCR儀產(chǎn)品工作原理
本產(chǎn)品與配套的微流控芯片配合使用,工作原理包括芯片 上樣、液滴生成、核酸擴(kuò)增、液滴檢測、廢料轉(zhuǎn)移等環(huán)節(jié)。 芯片上樣:操作軟件,將芯片進(jìn)樣倉彈出,把含有待測樣 本的反應(yīng)體系的芯片放入后,關(guān)閉進(jìn)樣倉,芯片將由調(diào)度系統(tǒng) 掃描和識別,完成芯片上樣。在實驗啟動后,儀器會不斷將進(jìn) 樣倉上的芯片取走,進(jìn)入后續(xù)流程。只要進(jìn)樣倉有空位,就可 以隨時加入新的芯片。
液滴生成:芯片由調(diào)度系統(tǒng)抓取到生成模塊進(jìn)行液滴生成操作。生成模塊在氣路的作用下將芯片中的反應(yīng)體系和微液滴 生成油驅(qū)動進(jìn)入芯片內(nèi)的液滴生成結(jié)構(gòu),在流體張力和剪切力 作用下,反應(yīng)體系周期斷裂,生成尺寸均一的液滴。生成的液 滴儲存在芯片的反應(yīng)管中。 核酸擴(kuò)增:完成液滴生成后,調(diào)度系統(tǒng)將芯片進(jìn)行翻轉(zhuǎn), 并放入 PCR 模塊中進(jìn)行 PCR 溫度循環(huán)。PCR 模塊按照設(shè)定的 程序,對位于芯片反應(yīng)管中的液滴進(jìn)行溫度循環(huán)控制,使得液 滴內(nèi)的靶基因在 PCR 反應(yīng)下不斷實現(xiàn)核酸擴(kuò)增。 液滴檢測:擴(kuò)增完的芯片由調(diào)度系統(tǒng)轉(zhuǎn)移到檢測模塊。檢 測模塊內(nèi)依次向芯片上的每個樣本注入檢測油。在檢測油的驅(qū) 動下,反應(yīng)管內(nèi)的液滴重新進(jìn)入芯片管道。在驅(qū)動油的和芯片 管道的作用下,液滴形成有序的液滴隊列,依次經(jīng)過檢測區(qū),在檢測區(qū)對依次經(jīng)過的每一個液滴進(jìn)行熒光激發(fā)。每個液滴中 的熒光染料經(jīng)激光照射后發(fā)射出特定波長的熒光。激發(fā)的熒光 被分到不同的光電信號轉(zhuǎn)換傳感器,光信號轉(zhuǎn)換成電信號,傳 給上位機系統(tǒng)并繪制成熒光散點圖。軟件依據(jù)液滴信號劃分陰 陽性,并通過數(shù)學(xué)模型精準(zhǔn)計算出樣本中模板的拷貝數(shù),通過 儀器配備的觸摸屏呈現(xiàn)給用戶。
廢料轉(zhuǎn)移:芯片檢測完成后被轉(zhuǎn)移到廢料倉。在所有處理的過程中,芯片始終保持密封狀態(tài),樣本的泄漏污染風(fēng)險低。 廢料箱可通過儀器面板打開,將廢料清空后放回儀器。
二、全自動數(shù)字PCR儀臨床試驗設(shè)計實例
本次臨床試驗在五家臨床試驗機構(gòu)進(jìn)行。臨床試驗選擇兩個具有代表性的項目驗證申報產(chǎn)品針對來源于人體樣本中的 DNA定性和定量檢測的臨床性能,所選項目為:人類腫瘤基因 EGFR 基因突變檢測項目和乙型肝炎病毒DNA定量檢測項目。
針對人類腫瘤基因EGFR基因突變檢測項目,臨床試驗納入非小細(xì)胞肺癌患者的血漿樣本。采用申報產(chǎn)品與配套的已定型的EGFR 突變檢測試劑作為考核儀器系統(tǒng),采用已上市的全自動熒光PCR分析儀與配套的已上市EGFR突變檢測試劑作為 對照儀器系統(tǒng),采用高通量測序方法(NGS)與配套的EGFR突變檢測試劑作為臨床參考系統(tǒng)。該試驗共納入518 例血漿樣 本,陽性樣本 253 例(覆蓋點突變、插入和缺失等各種變異類型,且每種變異類型均有一定的陽性例數(shù)),陰性樣本 265 例。試驗結(jié)果顯示:考核儀器系統(tǒng)與臨床參考系統(tǒng)比較的陽性符合 率為 96.8%(95%CI:93.9%,98.6%),陰性符合率為 99.3% (95%CI:97.3%,99.9%),對照儀器系統(tǒng)與臨床參考系統(tǒng)比 較的陽性符合率為 89.7%(95%CI:83.5%,91.9%),陰性符 合率為 98.9%(95%CI:96.7%,99.8%),考核儀器系統(tǒng)檢測性能優(yōu)于對照儀器系統(tǒng)。
針對乙型肝炎病毒DNA 定量檢測項目,臨床試驗納入乙型肝炎病毒感染患者的血漿樣本。采用申報產(chǎn)品與配套的已定型 乙型肝炎病毒DNA檢測試劑作為考核儀器系統(tǒng),采用臨床試驗機構(gòu)自建的數(shù)字PCR儀及其配套試劑作為臨床參考系統(tǒng)。該試驗共納入 354 例血漿樣本。定量統(tǒng)計分析結(jié)果顯示:考核儀器系統(tǒng)與臨床參考系統(tǒng)的相關(guān)系數(shù)為0.986,回歸方程為 y=1.068x -0.125,BA分析的一致性界限在臨床可接受標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)。定性統(tǒng)計 分析結(jié)果顯示:考核儀器系統(tǒng)與臨床參考系統(tǒng)的陽性符合率為100%,陰性符合率為100%,總符合率100%。
綜上所述,該產(chǎn)品臨床試驗設(shè)計符合《醫(yī)療器械臨床評價技術(shù)指導(dǎo)原則》的相關(guān)要求,臨床性能滿足技術(shù)審評要求。
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